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Biblioteca (s) :  INIA Las Brujas.
Fecha :  21/02/2014
Actualizado :  18/12/2018
Tipo de producción científica :  Artículos Indexados
Autor :  MISZTAL, I.; FRAGOMENI, B.; LOURENÇO, D. A. L.; TSURUTA, S.; MASUDA, Y.; AGUILAR, I.; LEGARRA, A.; LAWLOR, T. J.
Afiliación :  IGNACIO AGUILAR GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay.
Título :  Efficient inversion of genomic relationship matrix by the Algorithm for Proven and Young (APY).
Fecha de publicación :  2015
Fuente / Imprenta :  Interbull Bulletin, 2015, v. 49, p. 111-116.
Idioma :  Inglés
Contenido :  ABSTRACT. The purpose of this study was to evaluate properties of the inverse of the genomic relationship matrix derived with the algorithm for proven and young (APY) and the accuracy of genomic selection in single-step genomic best linear unbiased prediction (ssGBLUP). The APY implements genomic recursions on a subset of genotyped animals. When that subset is small, the cost of APY is approximately linear in memory and computations, effectively removing restrictions on the number of genotypes. Tests involved 10 102 702 final scores from 6 930 618 Holstein cows. A total of 100 000 animals with genotypes were used in the analyses and included 23 174 sires, 27 215 cows and 49 611 young animals. Genomic estimated breeding values (GEBVs) were calculated using ssGBLUP with a regular inverse of the genomic relationship matrix (G) and with G inverse from APY. Many subsets were tested including only sires, only cows and random samples from 2 000 to 20 000 animals. When the number of animals in the subset was ≥15,000, the correlations between GEBV with APY and GEBV with the regular inverse were ≥0.99. Best convergence rate was achieved with random samples. A theory on APY was derived and is based on the fact that additive effects of animals in the subset are linear functions of the effects of independent chromosome segments (ICSs); the number of segments is a function of the effective population size. Accuracy of GEBV with APY can be slightly superior to that of a regular... Presentar Todo
Palabras claves :  BIG POPULATION; GENOMIC RECURSION; INVERSION; SINGLE-STEP METHOD.
Asunto categoría :  --
URL :  http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/12204/1/1387-2387-1-PB.pdf
Marc :  Presentar Marc Completo
Registro original :  INIA Las Brujas (LB)
Biblioteca Identificación Origen Tipo / Formato Clasificación Cutter Registro Volumen Estado
LB12458 - 1PXIAP - DDPP/INTERBULL BULLETIN/2015

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1.Imagen marcada / sin marcar SCHILD, C.; RISSO, M.; TAFERNABERRY, J.; UDAQUIOLA, L.; SARAVIA, A.; BOABAID, F.; ALGORTA, J.; JAURENA, M.; RIET-CORREA, F. Respuesta de terneras de cría suplementadas con sales minerales en ambientes (suelo y forraje) con carencia severa y marginal de fósforo. In: AUPA, Proceedings del VII Congreso Uruguayo de Producción Animal. Sección Producción Animal Sostenible (Sustainable Animal Production Section), 14 y 15 diciembre 2021. Archivos Latinoamericanos de Producción Animal, 29(Supl.1), p.190-193. (Archivos Latinoamericanos de Producción Animal, Vol.29, Supl.1) Corresponding author: C. Schild, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Tacuarembó, Ruta 5 km 386, (Uruguay), mailto:cschild@inia.org.uy
Tipo: Trabajos en Congresos/Conferencias
Biblioteca(s): INIA Las Brujas.
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